早期基督教將灵魂分作“灵”(希臘文pneuma)和“魂”(希腊文psyche)两部份：“魂”（即生命力）是血肉的，所有生物都有的；“灵”（智慧或理性等人類的獨特表現）则是来自上天的，只有人類才擁有。因此，基督宗教地區會有“人类是万物之灵”之说。《聖經》的原文用詞“魂”（即希伯來文nephesh和希腊文psyche）顯示，並未將身體和“魂”加以劃分，而且描述“魂”是會死亡的。

原始基督教認為灵魂是不是不滅的，但可透過復活，最終會和同樣復活了的肉體一起到天堂或地獄。

根據《聖經》的描述，已死信徒的身體可能會改變，與得榮耀的耶穌的身體相似，所以靈魂即使會死也不重要。

但因受古希臘哲學新柏拉图主义的思想影響，中世紀的基督教信仰中，將人劃分為兩部分－灵魂與身体，在生之时是不分离的。

中世紀最廣泛的觀點認為靈魂是上帝所創造的，上帝為每一個新身體創造一個靈魂。這想法受到改革宗傳統和加爾文宗等支持，也為天主教所接受。另一個觀點則認為個人的靈魂承自父母。

因此，当有人被吓至昏迷之时，民间会举行一种特別的“招魂”仪式，意图使昏迷的人起死回生。

《大莊嚴論》：「諸婆羅門復作是言：『若無我者，誰至後世？』時憍尸迦語諸人言：『汝等善聽。從於過去煩惱諸業，得現在身，及以諸根；從今現在復造諸業，以是因緣，得未來身及以諸根。我於今者，樂說譬喻以明斯義，譬如穀子，眾緣和合，故得生芽，然此種子，實不生芽，種子滅故，芽便增長。子滅故不常，芽生故不斷。佛說受身亦復如是。雖復無我，業報不失。』」

在佛教傳入中國時，由於中國人重視先靈，因而使佛教慢慢變質而發展靈魂觀念。北傳佛教的喪禮中，一般會誦經超度以引導亡靈早登極樂西方，這只是北傳佛教的做法。南傳佛教則不承認有獨一的個體或靈魂存在，不過鬼是確實存在的。要區別的是：鬼并不是靈魂，在南傳佛教的教理，鬼與靈魂是完全不同的意思。

其後的新柏拉圖主義都有對靈魂作描述。他的學生亞里士多德的著作中曾將灵魂與心理學一同討論。亞里士多德將《論靈魂》列為“第二哲學”的範疇。對靈魂的定義，亞里士多德認為靈魂是形式，肉體只是質料，靈魂才是實體。靈魂分為3個部分，有理性、感覺和營養的機能。

及後來諾斯替主義的靈魂觀念，完成了日後西方民間信仰中靈魂的基本概念。